台海站积极开展海洋和生态环境科学知识传播与公众教育，每年举办“海洋科普开放日”，“海洋科普主题夏令营”，“湿地科普开放日”，“全国红树林保护和修复培训班”等，并通过与大中小学、企事业单位合作，开展不同层面的宣传教育与文化建设活动，着力提高全公民的海洋和生态环境保护意识，推动海洋和生态环境科学研究与教育的发展。

台海站先后获批国家海洋局“中国海洋科普基地”，国家海洋局“海洋意识教育基地”，全国水生野生动物保护协会“中国海龟傲虎联盟”成员单位，中国海洋科学卓越教育伙伴计划合作基地，中国生态学学会生态科普教育基地。