| 序号 | 项目名称 | 项目类型 | 项目负责人 | 起止时间 |
| 1 | 中国海生态系统固碳关键过程与调控机制 | 国家自然科学基金重点项目 | 黄邦钦 | 2022.01-2025.12 |
| 2 | 南海及邻近西太平洋浮游生物异养过程对生物泵的调控机制研究：深化和集成 | 国家自然科学基金重点项目 | 黄邦钦 | 2022.01-2025.12 |
| 3 | 典型新型污染物对海岸带生态系统服务功能的影响及其生态风险 | 国家自然科学基金重点项目 | 吕永龙 | 2021.01-2025.12 |
| 4 | 微生物海洋学 | 国家自然科学基金国家杰出青年科学基金 | 张 瑶 | 2022.01-2026.12 |
| 5 | 红树林生态学与滨海湿地生物入侵 | 国家自然科学基金国家杰出青年科学基金 | 张宜辉 | 2021.01-2025.12 |
| 6 | 海洋浮游植物生态学 | 国家自然科学基金优秀青年科学基金项目 | 柳 欣 | 2022.01-2024.12 |
| 7 | 海洋微型生物驱动与耦合的综合负排放机理 | 国家自然科学基金专项项目-研究项目 | 焦念志 | 2022.01-2025.12 |
| 8 | 中国海碳源汇格局、清单及不确定性 | 国家自然科学基金专项项目-研究项目 | 郭香会 | 2022.01-2025.12 |
| 9 | 科学传播类：基于野外科学观测研究站的海洋科学传播普及项目 | 国家自然科学基金专项项目-科普项目 | 江毓武 | 2022.01-2022.12 |
| 10 | 三倍体皱纹盘鲍不育或败育机制的研究 | 国家自然科学基金面上项目 | 柯才焕 | 2022.01-2025.12 |
| 11 | CO2倍增和海平面上升驱动下红树林生态系统的固碳功能演变 | 国家自然科学基金面上项目 | 陈鹭真 | 2021.01-2024.12 |
| 12 | 红树林湿地球囊霉素相关土壤蛋白的碳累积机理及分子稳定机制研究 | 国家自然科学基金面上项目 | 卢豪良 | 2021.01-2024.12 |
| 13 | 不同退塘还林模式对红树林生态功能影响的时间效应 | 国家自然科学基金面上项目 | 王 瑁 | 2021.01-2024.12 |
| 14 | 高位虾池清塘废水直排对红树林生态系统碳汇的影响及其机理与预测 | 国家自然科学基金面上项目 | 叶 勇 | 2021.01-2024.12 |
| 15 | 红树林湿地土壤纤毛虫原生动物多样性及时空异质性研究 | 国家自然科学基金面上项目 | 林晓凤 | 2021.01-2024.12 |
| 16 | 海岛繁殖易危候鸟黄嘴白鹭的迁徙行为研究 | 国家自然科学基金面上项目 | 方文珍 | 2021.01-2024.12 |
| 17 | 植物跨代效应的表观遗传机制研究 | 国家自然科学基金面上项目 | 张原野 | 2021.01-2024.12 |
| 18 | 入侵植物互花米草对潮位变化的可塑性和异速生长响应机制 | 国家自然科学基金青年科学基金项目 | 刘文文 | 2021.01-2024.12 |
| 20 | 海水营养盐智能分析仪器的研制与示范应用 | 省部级(福建省海洋经济发展专项资金) | 马 剑 | 2021.01-2022.12 |
| 21 | 国家贝类产业技术体系岗位科学家-鲍种质资源与品种改良（2021） | 省部级(农业部科技项目) | 柯才焕 | 2021.01-2022.12 |
| 22 | 国家虾蟹产业技术体系岗位专家项目 | 省部级（农业部科技项目） | 毛 勇 | 2021.01-2021.12 |
| 23 | 红树林湿地中球囊霉素相关土壤蛋白对土壤碳稳定机理研究 | 省部级(福建省国家自然科学基金计划面上项目) | 卢豪良 | 2021.11-2024.11 |
| 24 | 海洋负碳排放的研发策略 | 其他 | 焦念志 | 2021.01-2022.12 |
| 25 | 绿盘鲍新品种产业化示范 | 其他 | 柯才焕 | 2021.01-2024.07 |
| 26 | 藻类在线监测技术与样机研发 | 其他 | 陈纪新 | 2021.01-2023.12 |
| 27 | 厦门湾海漂垃圾漂移轨迹预测系统业务化运行 | 其他 | 江毓武 | 2021.07-2022.12 |
| 28 | 省级国土空间生态修复规划编制工作服务类采购项目 | 其他 | 曹文志 | 2021.03-2021.06 |
| 29 | 全省港湾精细化流场数值模式（一期） | 其他 | 江毓武 | 2021.07-2022.12 |
| 30 | 福建省典型滨海湿地碳汇潜力评估项目政府采购合同 | 其他 | 朱旭东 | 2021.01-2021.10 |
| 31 | 典型半封闭海湾生物治理模式研究 | 其他 | 黄凌风 | 2021.08-2022-07 |
| 32 | 厦门市下谭尾红树林公园红树林科研科普工作技术支持 | 其他 | 李庆顺 | 2021.04-2022.03 |
| 33 | 海洋观测数据质控处理与模型研究服务 | 其他 | 陈能汪 | 2021.01-2021.12 |
| 34 | 保护地红树林保护及修复培训课程研发研究合作协议 | 其他 | 王文卿 | 2021.11-2022.05 |
| 35 | 东山县鲍鱼养殖产业发展规划编制 | 其他 | 柯才焕 | 2021.04-2021.12 |
| 36 | 闽南-台湾浅滩渔场梭子蟹资源及海马栖息地调查 | 其他 | 刘 敏 | 2021.10-2022.09 |
| 37 | 福建漳江口及广东内伶仃岛-福田国家级自然保护区红树植物群落、红树林面积及分布调查 | 其他 | 王文卿 | 2021.09-2022.01 |
| 38 | 泉州湾洛阳江（江心岛）红树林蓝碳交易碳汇核算报告 | 其他（技术服务） | 陈鹭真 | 2021.09-2021.09 |
| 39 | 福建省红树林生态碳汇遥感调查评估 | 其他（技术服务） | 朱旭东 | 2021.12-2022.01 |
