为长期跟踪监测红树林及盐沼湿地植被生长情况、湿地面积变化、外来物种入侵情况，及其对全球气候变化和人类活动的响应等，在漳江口实验场设置了6个红树林永久样地，观测频率为每年1次，观测指标包括红树植物群落种类、高度、密度、胸径以及红树植物凋落物的类别、质量等，同时设置了10个盐沼植物样地，观测频率同样为每年1次，观测指标包括盐沼植物群落种类、高度、密度、基径等。以上观测为红树林生态系统研究，红树林湿地蓝碳以及互花米草入侵红树林的格局、过程和机制研究提供重要支撑。